5월 종합소득세 신고 전에 놓치면 손해 보는 공제 7가지

5월은 종합소득세 신고의 달입니다. 특히 프리랜서나 개인사업자라면 이 시즌이 부담스러울 수 있는데, 막상 신고를 마치고 나서 "아, 이 공제를 놓쳤네" 싶은 경우가 많습니다.

매년 반복되는 실수를 방지하려면 신고 전에 꼼꼼히 챙겨야 할 공제 항목을 미리 정리해두는 게 좋습니다. 이번 글에서는 5월 종합소득세 신고 전에 꼭 확인해야 할 공제 7가지를 알려드립니다.

연금저축과 퇴직연계좌, 한도 내에서 최대한 채웠는지 확인하세요

종합소득세 공제에서 가장 놓치기 쉬운 항목 중 하나가 연금저축계좌와 퇴직연금계좌(DC형, IRP 등) 납입액입니다. 국세청 자료에 따르면 연금저축계좌에는 연금저축보험, 펀드, 신탁, 공제 등이 포함되며, 퇴직연금계좌는 확정기여형(DC)과 개인형IRP가 해당됩니다.

이 두 계좌에 납입한 금액은 연간 최대 700만 원(연금저축 400만 원 + 퇴직연금 300만 원)까지 세액공제 대상이 됩니다. 소득에 따라 공제율이 달라지지만, 총급여 5,500만 원 이하라면 15%, 초과라면 12%가 공제됩니다.

12월 말까지 납입한 금액만 대상이므로, 작년에 700만 원을 다 채우지 못했다면 올해 신고 시에는 반영할 수 없습니다. 신고 전에 본인이 납입한 금액을 홈택스에서 조회해보고 누락된 부분이 없는지 꼭 확인하세요.

단순경비율 대상 여부를 다시 한 번 체크하세요

사업소득자의 경우 필요경비를 인정받는 방식이 크게 두 가지입니다. 단순경비율 대상자와 기준경비율 대상자로 나뉘는데, 단순경비율을 적용받으면 소득금액 계산이 훨씬 유리할 수 있습니다.

국세청 고시에 따르면 단순경비율 적용 대상은 직전 연도(2024년) 연간 수입금액이 업종별 기준금액 미만인 사업자입니다. 예를 들어 도소매업은 6억 원, 제조업은 3억 원, 서비스업은 7,500만 원 등 업종마다 기준이 다릅니다.

만약 자신이 단순경비율 대상자인데도 기준경비율로 신고했다면, 필요경비를 덜 인정받아 세금을 더 내게 됩니다. 홈택스에서 '단순경비율 적용 대상 조회'를 해보고, 해당된다면 반드시 단순경비율로 신고하세요.

일자리 안정자금은 수입금액에서 제외해야 합니다

정부 지원금 중 하나인 '일자리 안정자금'은 사업자의 수입금액에 포함되지 않는다는 점을 아는 분이 생각보다 많지 않습니다. 국세청은 2020년 2월 11일 이후 결정·경정하는 분부터 단순경비율 대상자의 소득금액 계산 시 일자리 안정자금을 수입금액에서 제외하도록 명시했습니다.

즉, 작년에 일자리 안정자금을 지원받았다면 그 금액을 총수입금액에 포함하지 않고 신고해야 합니다. 만약 실수로 포함해서 신고했다면 필요경비율이 낮아져 소득이 과다하게 잡혀 세금 부담이 늘어납니다.

지급받은 금액과 관련 서류를 미리 준비해두세요.

기타소득 필요경비율, 60% 적용되는 경우를 꼭 확인하세요

강연료, 원고료, 자문료 등 기타소득은 필요경비율이 60%로 적용됩니다. 국세청 예시를 보면 강연료 연간 총지급액이 800만 원일 때 기타소득금액은 320만 원(800만 원 - 800만 원 × 60%)이 됩니다.

이는 소득세 부담을 크게 줄여주는 요소입니다. 하지만 기타소득이 연간 300만 원을 초과하면 종합소득에 합산되어 신고해야 한다는 점을 간과하는 경우가 많습니다.

300만 원 이하라면 분리과세로 종결되지만, 초과분은 반드시 종합소득세 신고 시 포함해야 합니다. 본인이 받은 기타소득 내역을 지급명세서와 대조해 누락된 게 없는지 확인하세요.

복식부기 의무자라면 추계과세 시 기준경비율의 1/2 적용을 기억하세요

전문직 사업자(변호사, 회계사, 세무사 등)는 2007년 1월 1일 이후 발생하는 소득부터 수입금액에 상관없이 복식부기 의무가 부과됩니다. 만약 장부를 제대로 기록하지 못해 추계과세를 받게 된다면, 기준경비율의 1/2만 적용됩니다.

예를 들어 기준경비율이 20%라면 실제로는 10%만 인정받는 셈입니다. 이 경우 소득금액이 훨씬 높게 산출되므로 가급적 복식부기를 통해 실제 경비를 증빙하는 게 유리합니다.

올해 신고 전에 장부 정리가 어렵다면 세무사와 상담해 대안을 마련하는 게 좋습니다.

무신고가산세와 납부지연가산세, 기본 구조를 이해해야 피할 수 있습니다

기한 내 신고·납부하지 않으면 무신고가산세와 납부지연가산세가 부과됩니다. 국세청 자료에 따르면 무신고가산세는 두 가지 방식 중 큰 금액이 적용됩니다.

첫째는 무신고납부세액의 20%(국제거래 수반 시 40% 또는 60%), 둘째는 수입금액의 0.07%(국제거래 시 0.14%)입니다. 납부지연가산세는 납부기한 다음 날부터 자진납부일까지의 미납 기간에 대해 매일 일정 비율로 계산됩니다.

게다가 장부 기록·보관 불성실가산세(산출세액의 20%)와 동시에 적용될 경우, 더 큰 가산세만 적용됩니다. 신고 기한이 공휴일이나 토요일인 경우 다음날까지 신고 가능하니, 5월 31일이 토요일이면 6월 1일까지로 착각하지 말고 정확히 확인하세요.

배율 적용 시 간편장부 대상자와 복식부기 의무자의 차이를 알면 유리합니다

2025년 귀속 종합소득세 신고 시 적용되는 배율이 국세청에서 고시됐습니다. 간편장부대상자는 2.8배, 복식부기의무자는 3.4배입니다.

이 배율은 소득금액을 추계로 계산할 때 사용되는데, 실제 소득이 적더라도 배율이 높으면 소득이 과대 계산될 위험이 있습니다. 예를 들어 간편장부대상자라면 수입금액에서 단순경비율을 적용한 후 2.8배를 곱해 소득금액을 산출합니다.

만약 장부 기록이 가능하다면 실제 경비를 증빙해 배율 적용을 피하는 게 좋습니다. 특히 매출이 작은 소규모 사업자라면 배율 적용 여부에 따라 세 부담이 크게 달라지니 반드시 확인하세요.

Q. 홈택스에서 종합소득세 신고는 어떻게 하나요?

국세청 홈택스(www.hometax.go.kr)에 로그인 후 '종합소득세 신고서비스'를 클릭하고, 신고서를 선택해 작성·제출하면 됩니다. 신고 완료 후 '개인지방소득세 신고 이동' 버튼을 눌러 위택스에서 지방소득세도 함께 신고해야 합니다.

Q. 티몬·위메프 정산 지연 피해 사업자는 납부기한 연장이 가능한가요?

네, 가능합니다. 홈택스 로그인 후 '증명·등록·신청·사업자현황' > '세금관련 신청·신고 공통분야' > '신고·납부 기한연장 신청/내역조회'에서 신고분 납부기한 연장신청을 할 수 있습니다.

손택스 앱에서도 동일한 경로로 신청 가능합니다.

Q. 카드로 납부하는 방법이 있나요?

2026년 5월 22일부터 '카드로택스' 서비스가 종료됩니다. 따라서 카드 납부는 더 이상 지원되지 않으니, 계좌이체나 가상계좌, 인터넷 지로 등을 이용해야 합니다.

5월 종합소득세 신고는 한 해의 세금 부담을 결정짓는 중요한 과정입니다. 위에서 언급한 공제 항목들을 하나씩 체크리스트로 만들어 신고 전에 반드시 확인하세요.

특히 연금저축 납입액, 단순경비율 적용 여부, 일자리 안정자금 제외 등은 생각보다 많은 분이 놓치는 부분입니다. 가산세를 피하려면 기한을 꼭 지키고, 조금이라도 의문이 들면 국세상담센터(126)에 문의하거나 세무사와 상담하는 걸 추천합니다.